Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3CQ9BUI4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3CQ9BUI4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms