Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms