Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BPIFA3Q9BQP9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BPIFA3Q9BQP9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms