Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TREX2Q9BQ50 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms