Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CHP1Q99653 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms