Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP88Q99567 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms