Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CRBNQ96SW2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CRBNQ96SW2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms