Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CRAMP1Q96RY5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRAMP1Q96RY5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms