Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYNGAP1Q96PV0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYNGAP1Q96PV0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms