Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GBP4Q96PP9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GBP4Q96PP9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms