Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
JSRP1Q96MG2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
JSRP1Q96MG2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms