Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FGD4Q96M96 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FGD4Q96M96 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms