Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKNOX2Q96KN3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKNOX2Q96KN3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms