Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COX4I2Q96KJ9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.6 ms