Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HIC2Q96JB3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HIC2Q96JB3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms