Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LTV1Q96GA3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTV1Q96GA3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms