Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
MALSU1Q96EH3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms