Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSUN4Q96CB9 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSUN4Q96CB9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSUN4Q96CB9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms