Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC47Q96A33 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC47Q96A33 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms