Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX21Q969T3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms