Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SCG3Q8WXD2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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