Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
BRK1Q8WUW1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms