Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATG16L2Q8NAA4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms