Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD42Q8N9B4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD42Q8N9B4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms