Protein–RNA interactions for Protein: Q8N987

NECAB1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAB1Q8N987 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NECAB1Q8N987 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NECAB1Q8N987 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms