Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CHCHD4Q8N4Q1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CHCHD4Q8N4Q1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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