Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDCL2Q8N4E4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDCL2Q8N4E4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms