Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C9orf40Q8IXQ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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C9orf40Q8IXQ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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C9orf40Q8IXQ3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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C9orf40Q8IXQ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C9orf40Q8IXQ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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