Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SV2AQ7L0J3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms