Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUM4

ARHGAP27, Rho GTPase-activating protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP27Q6ZUM4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARHGAP27Q6ZUM4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP27Q6ZUM4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP27Q6ZUM4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP27Q6ZUM4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP27Q6ZUM4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP27Q6ZUM4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARHGAP27Q6ZUM4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms