Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC73Q6ZRK6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC73Q6ZRK6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms