Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NFXL1Q6ZNB6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms