Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCBE1Q6UXH8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms