Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SFTA2Q6UW10 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SFTA2Q6UW10 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms