Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LARP1Q6PKG0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LARP1Q6PKG0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms