Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KCNIP4Q6PIL6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KCNIP4Q6PIL6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms