Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MCTP1Q6DN14 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MCTP1Q6DN14 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms