Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
CARMIL1Q5VZK9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CARMIL1Q5VZK9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms