Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 KCNMA1-291ENST00000640834 3664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OBSCNQ5VST9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms