Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1R4

HIVEP3, Transcription factor HIVEP3, humanhuman

Predictions only

Length 2,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3Q5T1R4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIVEP3Q5T1R4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIVEP3Q5T1R4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms