Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC158Q5M9N0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC158Q5M9N0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms