Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNF212Q495C1 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RNF212Q495C1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms