Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BBS9Q3SYG4 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BBS9Q3SYG4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms