Protein–RNA interactions for Protein: Q24JQ0

TMEM241, Transmembrane protein 241, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM241Q24JQ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM241Q24JQ0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms