Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SGCAQ16586 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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SGCAQ16586 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SGCAQ16586 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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SGCAQ16586 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SGCAQ16586 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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