Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RBBP7Q16576 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RBBP7Q16576 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms