Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC18A3Q16572 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC18A3Q16572 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
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