Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SYPL1Q16563 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SYPL1Q16563 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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