Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
DDB1Q16531 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DDB1Q16531 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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