Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
RPE65Q16518 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RPE65Q16518 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RPE65Q16518 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RPE65Q16518 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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RPE65Q16518 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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RPE65Q16518 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPE65Q16518 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
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